Глосарій
Хімічний склад клітини
А
Нуклеотид, що складається з аденіну, рибози та трьох залишків фосфатної кислоти; універсальний переносник енергії в клітині.
Невелика ділянка на поверхні ферменту, утворена радикалами амінокислот завдяки третинній структурі білка. Саме активний центр зв'язує субстрат і здійснює каталітичне перетворення.
Органічна сполука, що містить аміногрупу (-NH2) і карбоксильну групу (-COOH), приєднані до одного атома Карбону, а також радикал R, який визначає властивості кожної амінокислоти. У складі білків трапляється 20 стандартних амінокислот.
Б
Жива система (клітина, організм, популяція, екосистема, біосфера), яка є відкритою (обмінюється з середовищем речовиною, енергією та інформацією), ієрархічною та здатною до саморегуляції.
Пара «слабка кислота + її сіль», яка зв'язує надлишок іонів H⁺ або OH⁻, запобігаючи різким змінам pH. Головна буферна система плазми крові людини — гідрокарбонатна H₂CO₃ / HCO₃⁻, яка підтримує pH близько 7,4. Усередині клітин діє фосфатна система H₂PO₄⁻ / HPO₄²⁻.
В
Один повний оберт подвійної спіралі ДНК, який у спрощеній шкільній моделі містить приблизно 10 пар нуклеотидів і має довжину 3,4 нм.
Слабке електростатичне притягання між атомом Гідрогену з частковим позитивним зарядом (δ⁺) однієї молекули й атомом Оксигену (або іншого електронегативного елемента) з частковим негативним зарядом (δ⁻) іншої молекули. Кожна молекула води утворює до чотирьох водневих зв'язків.
Естери вищих жирних кислот і вищих одноатомних спиртів. Тверді, водовідштовхувальні речовини, що утворюють захисні покриви на листках, плодах, пір'ї, шерсті, а також входять до складу бджолиного воску й вушної сірки.
Г
Ділянка ДНК із певною послідовністю нуклеотидів, яка містить інформацію для утворення функціональної РНК або поліпептидного продукту.
Реакція розщеплення полімерів на мономери, у якій бере участь молекула води. Наприклад, крохмаль (полісахарид) гідролізує до глюкози, а білок — до амінокислот. Вода приєднується до місця розриву хімічного зв'язку.
Речовини, які мають полярні або заряджені групи й тому легко взаємодіють із водою. Більшість гідрофільних речовин (солі, цукри, амінокислоти) розчинні у воді, але деякі (наприклад, целюлоза) лише набухають, не розчиняючись.
Неполярні речовини, які не взаємодіють із водою й не розчиняються в ній. До гідрофобних належать жири, олії, воски, стероїди (холестерол), каротиноїди. Вони добре розчиняються в органічних розчинниках (ефір, бензин, хлороформ).
Припущення, яке можна перевірити дослідом; часто формулюють у формі «якщо…, то…». Гіпотезу висувають до початку досліду, а після отримання результатів її підтверджують або спростовують.
Запасний полісахарид тварин і грибів («тваринний крохмаль»). Мономер — глюкоза. Має дуже розгалужену структуру, що забезпечує швидке вивільнення глюкози. Найбільше міститься в печінці та скелетних м'язах.
Білки, поліпептидний ланцюг яких згорнутий у компактну кулясту глобулу. Більшість глобулярних білків розчинні у воді. Приклади: ферменти, гемоглобін, антитіла, альбумін, інсулін.
Д
Позасистемна одиниця маси, яку використовують у біохімії та молекулярній біології для позначення маси молекул. 1 Да = 1 а. о. м. = 1,66 · 10^-24 г. Чисельно дорівнює 1/12 маси атома Карбону-12. Масу білків і нуклеїнових кислот часто подають у кілодальтонах (кДа).
Біополімер, що складається з двох антипаралельних ланцюгів нуклеотидів із дезоксирибозою та основами А, Г, Ц, Т; зберігає й передає спадкову інформацію.
Порушення природної просторової структури білка (четвертинної, третинної, вторинної) під дією високої температури, кислот, лугів, солей важких металів, спирту або опромінення. Первинна структура зберігається, але білок втрачає функцію.
Е
Метод дослідження, за якого дослідник навмисно змінює одну умову (незалежну змінну) й порівнює результат у дослідному варіанті з контрольним, де умову не змінювали.
Збільшення щитоподібної залози внаслідок дефіциту йоду в їжі та воді; профілактика — йодована сіль і морепродукти.
Хвороби, поширені в певній місцевості через нестачу або надлишок певного хімічного елемента в ґрунті та воді. Приклад: ендемічний зоб у регіонах із дефіцитом Йоду.
Енергетичний бар'єр, який потрібно подолати, щоб хімічна реакція відбулася. Ферменти знижують енергію активації, завдяки чому реакція прискорюється в мільйони разів.
Ж
Тригліцериди — естери триатомного спирту гліцеролу й трьох вищих жирних кислот. Виконують енергетичну (38,9 кДж/г), запасну, теплоізоляційну, захисну функції та є джерелом метаболічної води.
Вищі карбонові кислоти, що входять до складу жирів, фосфоліпідів і восків. Поділяються на насичені (без подвійних зв'язків, дають тверді жири) та ненасичені (з подвійними зв'язками, дають рідкі олії).
З
Показник, який вимірюють у досліді; його значення залежить від зміни незалежної змінної (наприклад, частка пророслого насіння, довжина паростка, кількість бульбашок газу за хвилину). Її відкладають на осі ординат (вертикальній осі) графіка.
Стан, спричинений нестачею Феруму в організмі, що призводить до зменшення вмісту гемоглобіну в еритроцитах. Симптоми: блідість, утома, задишка.
І
Речовина, яка пригнічує активність ферменту. Конкурентні інгібітори схожі на субстрат і займають активний центр; неконкурентні зв'язуються з іншою ділянкою ферменту, змінюючи форму активного центру.
К
Варіант досліду без дії досліджуваного чинника або за звичайних (стандартних) умов. Слугує базою для порівняння: дослідний варіант має відрізнятися від контролю лише одним чинником.
Просторова форма молекули білка, якої вона набуває в розчині завдяки взаємодії між амінокислотними залишками. Від конформації залежить, чи зможе білок виконувати свою біологічну функцію.
Органічна небілкова молекула, яка входить до складу складного ферменту як кофактор. Часто є похідним вітамінів (особливо групи B). Без коферменту складний фермент не працює.
Запасний полісахарид рослин. Складається з амілози (нерозгалужені ланцюги) й амілопектину (розгалужені ланцюги). Мономер — глюкоза. Накопичується в лейкопластах бульб, насіння. Якісна реакція — синє забарвлення з розчином йоду.
Л
Неоднорідна група органічних речовин, переважно нерозчинних у воді (гідрофобних), але розчинних в органічних розчинниках. Основні групи ліпідів за програмою НМТ: жири, фосфоліпіди, стероїди, воски.
М
Хімічні елементи, вміст яких у клітині перевищує 0,01 % маси. Крім органогенних (C, H, O, N), до макроелементів належать P, S, K, Na, Ca, Mg, Cl і Fe (у шкільній класифікації).
Хімічний зв'язок між залишками фосфатної кислоти в АТФ, гідроліз якого вивільняє значну кількість енергії (≈ 40 кДж/моль для навчальних задач).
Відношення маси атомів певного елемента в молекулі до загальної молекулярної маси, виражене у відсотках. Обчислюється за формулою w = n · A_r / M_r · 100 %, де n — кількість атомів елемента, A_r — його відносна атомна маса, M_r — відносна молекулярна маса сполуки.
Те, що саме треба встановити в дослідженні; формулюють дієсловом (з'ясувати, визначити, порівняти, дослідити). Мета відповідає на питання «що саме треба зробити?» і передує вибору методу й обладнання.
Вода, що утворюється в клітинах під час окиснення органічних речовин, особливо жирів. Окиснення 1 г жиру дає понад 1 г води. Важливе джерело води для верблюдів у пустелі та тварин під час сплячки.
Хімічні елементи, вміст яких у клітині менший за 0,01 % маси. До мікроелементів належать I, Zn, Cu, Co, Mn, F. Незважаючи на малу частку, вони виконують важливі функції.
Найменша можлива молекулярна маса білка, обчислена в припущенні, що в його складі є лише один атом певного елемента (або один залишок певної амінокислоти). Обчислюється за формулою M_min = A_r · 100 % : w, де w — масова частка елемента (або залишку амінокислоти) у відсотках.
Метод дослідження, за якого об'єкт або процес вивчають на його спрощеній копії — фізичній, математичній або комп'ютерній моделі. Застосовують, коли об'єкт недоступний, надто великий, повільний або небезпечний.
Маса молекули, виражена в атомних одиницях маси (а. о. м.) або в дальтонах (Да). Чисельно дорівнює сумі атомних мас усіх атомів, що входять до складу молекули. Відносна молекулярна маса M_r — безрозмірна величина, яка чисельно збігається з масою молекули в дальтонах.
Тривале систематичне спостереження за станом об'єкта з повторними вимірюваннями в часі, щоб оцінити поточний стан, виявити тенденції та спрогнозувати зміни. Дослідник нічого не змінює.
Найпростіші вуглеводи, які не гідролізуються (не розщеплюються на простіші вуглеводи). Мають солодкий смак, добре розчинні у воді. За кількістю атомів Карбону розрізняють тріози, тетрози, пентози, гексози тощо; найважливіші — пентози (C₅) і гексози (C₆). Приклади: глюкоза, фруктоза, рибоза, дезоксирибоза.
Н
Чинник, який дослідник навмисно змінює в ході експерименту (наприклад, температура, освітлення, концентрація речовини). Її відкладають на осі абсцис (горизонтальній осі) графіка.
Амінокислоти, які організм людини не здатен синтезувати й мусить отримувати з їжею. Їх дев'ять: валін, лейцин, ізолейцин, лізин, метіонін, треонін, триптофан, фенілаланін і гістидин.
Мономер нуклеїнових кислот, що складається з азотистої основи, пентози (дезоксирибози або рибози) та залишку фосфатної кислоти.
Співвідношення чотирьох типів нуклеотидів (А, Т, Г, Ц) у молекулі ДНК, яке підпорядковується правилу Чаргаффа: А = Т, Г = Ц, А + Г = Т + Ц = 50 %.
О
Вуглеводи, що складаються з 2–10 залишків моносахаридів, сполучених глікозидним зв'язком. Найважливіші олігосахариди — дисахариди: сахароза (глюкоза + фруктоза), лактоза (глюкоза + галактоза), мальтоза (глюкоза + глюкоза).
Чотири хімічні елементи — Карбон (C), Гідроген (H), Оксиген (O) і Нітроген (N), — які становлять основу органічних сполук і разом дають близько 98 % маси клітини.
П
Два комплементарні нуклеотиди, розташовані в різних ланцюгах ДНК навпроти один одного: А–Т або Г–Ц. Кількість пар визначає довжину молекули ДНК.
Ковалентний зв'язок -CO-NH-, що утворюється між карбоксильною групою однієї амінокислоти й аміногрупою наступної з виділенням молекули води. Сполучає амінокислоти в поліпептидний ланцюг.
Азотисті основи з однокільцевою структурою: тимін (Т) і цитозин (Ц) у ДНК; у РНК замість тиміну — урацил (У). У дволанцюговій ДНК сума піримідинів дорівнює сумі пуринів.
Проведення кожного варіанту досліду кілька разів або на достатній кількості об'єктів (наприклад, три чашки по 20 насінин замість однієї). Повторність зменшує вплив випадковості й робить висновки надійнішими.
Здатність живих організмів реагувати на зміни навколишнього середовища (подразники). Приклади: фототропізм рослин, таксиси найпростіших, рефлекси тварин.
Біополімери, що складаються із сотень або тисяч залишків моносахаридів (мономерів). Несолодкі, нерозчинні або погано розчинні у воді. Приклади: крохмаль, глікоген, целюлоза, хітин.
Молекула, у якій електричний заряд розподілений нерівномірно: один кінець несе частковий негативний заряд (δ⁻), інший — частковий позитивний (δ⁺). Молекула води H₂O — типовий диполь через більшу електронегативність Оксигену.
Метод біологічного дослідження, що полягає в спостереженні, описі та порівнянні об'єктів без втручання в їхнє життя. Найдавніший метод, основа систематики.
Правило, згідно з яким у дволанцюговій ДНК кількість аденіну дорівнює кількості тиміну (А = Т), а кількість гуаніну дорівнює кількості цитозину (Г = Ц); звідси А + Г = Т + Ц = 50 %.
Правило, за яким азотисті основи в нуклеїнових кислотах сполучаються лише певним чином: аденін — з тиміном (або урацилом), гуанін — із цитозином.
Азотисті основи з двокільцевою структурою: аденін (А) і гуанін (Г). У дволанцюговій ДНК сума пуринів дорівнює сумі піримідинів (А + Г = Т + Ц).
Р
Самовільне відновлення природної конформації білка після усунення денатурувального чинника. Можлива, якщо первинна структура не порушена, а денатурація була м'якою.
Біополімер, зазвичай з одного ланцюга нуклеотидів із рибозою та основами А, Г, Ц, У; бере участь у реалізації спадкової інформації (синтезі білка).
Ієрархічні рівні, на яких існують біологічні системи: за програмою НМТ — молекулярний, клітинний, організмовий, екосистемний і біосферний. Кожен вищий рівень містить нижчі й має нові властивості.
С
Здатність організму підтримувати сталість внутрішнього середовища (гомеостаз), зокрема температуру тіла, pH крові, вміст води й солей, незалежно від змін зовнішніх умов.
Усереднена маса одного амінокислотного залишку в складі білка. Беруть значення, наведене в умові задачі (часто 100, 110 або 120 Да). Не плутати з масою вільної амінокислоти, яка на 18 Да більша через наявність молекули води, що виділяється під час утворення пептидного зв'язку.
Усереднена маса одного нуклеотида в складі нуклеїнової кислоти. Поширене значення — 345, але в задачах НМТ завжди беруть те, що дано в умові. Маса нуклеотида враховує залишок фосфатної групи, цукру (дезоксирибози або рибози) й азотистої основи.
Властивість ферменту діяти лише на певний субстрат (субстратна специфічність) і каталізувати лише один тип хімічної реакції (специфічність дії). Зумовлена будовою активного центру.
Ліпіди, основою яких є чотири сполучені вуглеводневі кільця (циклопентанпергідрофенантрен). Не є естерами гліцеролу й жирних кислот. До стероїдів належать холестерол, статеві гормони, гормони кори наднирників, жовчні кислоти, вітамін D.
Речовина, на яку діє фермент. Субстрат зв'язується з активним центром ферменту, утворюючи фермент-субстратний комплекс, після чого перетворюється на продукт реакції.
Т
Значення температури, за якого активність ферменту максимальна. Для більшості ферментів людини становить близько 37-40 °C. Вище оптимуму активність падає через денатурацію білка.
Фізична величина, яка показує, скільки теплоти потрібно, щоб нагріти тіло на 1 °C; питома теплоємність — скільки теплоти потрібно, щоб нагріти 1 кг речовини на 1 °C. Питома теплоємність води становить близько 4,2 кДж/(кг·°C) — це одне з найвищих значень серед відомих речовин, тому вода повільно нагрівається й повільно охолоджується.
Ф
Біологічний каталізатор, переважно білкової природи, що прискорює хімічні реакції в живих організмах, знижуючи енергію активації, і не витрачається в реакції. Виняток становлять рибозими — каталітичні РНК.
Білки з видовженою ниткоподібною формою молекули. Вони нерозчинні у воді й мають високу механічну міцність. Приклади: колаген, кератин, фіброїн, еластин.
Ураження зубної емалі (плямистість, крихкість), спричинене надмірним надходженням Флуору в організм під час формування зубів. Тривалий значний надлишок Флуору також уражує кістки.
Ліпіди, що складаються з гліцеролу, двох залишків жирних кислот і залишку фосфатної кислоти з полярною групою. Амфіфільні: мають гідрофільну голівку й два гідрофобні хвости. Утворюють подвійний шар — основу біологічних мембран.
Х
Азотовмісний структурний полісахарид. Входить до складу клітинної стінки грибів і зовнішнього скелета членистоногих (ракоподібних, павукоподібних, комах). У рослин не трапляється.
Стероїд, що входить до складу мембран клітин тварин (надає їм пружності) і є вихідною речовиною для синтезу стероїдних гормонів, жовчних кислот і вітаміну D.
Ц
Структурний полісахарид, основа клітинної стінки рослин. Мономер — глюкоза. Утворює довгі нерозгалужені ланцюги, що формують міцні волокна. У людини не перетравлюється через відсутність ферменту целюлази.